เมื่อเวลา 13.00 น. วันที่ 16 ก.พ. พ.ต.อ.ไพสิฐ วงศ์เมือง อธิบดีกรมสอบสวนคดีพิเศษ พล.ต.ท.ชาญเทพ เสสะเวช ผบช.ภ.1 พร้อมเจ้าหน้าที่ดีเอสไอ ได้เดินทางมาที่ประตู 1 ของวัดพระธรรมกาย จากนั้นได้เจรจากับพระและลูกศิษย์ที่มาอยู่บริเวณดังกล่าวเพื่อให้เปิดประตู ซึ่งก็เจรจาได้ไม่นานทางพระและลูกศิษย์วัดจึงยอมเปิดประตูให้เจ้าหน้าที่ไปภายใน จากนั้นจึงได้เข้าตรวจค้นภายในพื้นที่ 198 ไร่ ที่คาดว่าจะเป็นที่พักอาศัยของพระธัมมชโย ซึ่งประตูนี้อยู่ใกล้กับกุฏิของพระธัมมชโยที่สุด โดยมีศิษยานุศิษย์วัดพระธรรมกายนั่งสวดมนต์กันอยู่บริเวณภายในวัดจำนวนมาก
เมื่อเจ้าหน้าที่ดีเอสไอได้ไปภายในได้เพื่อตรวจค้น ศิษย์วัดพระธรรมกายบางส่วนได้เดินตามเจ้าหน้าที่ไปด้วย โดยเจ้าหน้าที่สามารถเข้าไปภายในวัดพระธรรมกายเรียบร้อยแล้ว โดยไม่มีศิษยานุศิษย์และพระสงฆ์เข้ามาขัดขวางแต่อย่างใด ขณะที่เจ้าหน้าที่ทหารได้ขอร้องให้สื่อมวลชนเข้าเก็บภาพได้ตรงจุดที่จัดให้ไว้เท่านั้น ซึ่งก็ยังไม่มีใครบอกได้ว่าจะใช้เวลานานเท่าใด ขณะที่เจ้าหน้าที่ตำรวจภูธรภาค 1 ได้เข้ามาเสริมกำลังอยู่ตลอดเป็นระยะๆ ซึ่งบรรยากาศโดยรวมเป็นไปในทางบวก หลังจากที่เข้ามาปิดล้อมตั้งแต่ช่วงเช้าที่ผ่านมาทางวัดให้ความร่วมมือเป็นอย่างดี
