สมาคมบอล ได้รับความเสียหายไม่ต่างจากสมาคมกีฬาอื่นที่อยู่ภายในการกีฬาแห่งประเทศไทย หลังโดนน้ำท่วมขังมานานหลายวันต้องเร่งฟื้นฟูอาคารสำนักงาน
จากเหตุอุทกภัยและน้ำท่วมขังอย่างรวดเร็วบริเวณโดยรอบสนามราชมังคลากีฬาสถาน หัวหมาก ส่งผลกระทบโดยตรงต่อที่ทำการสมาคมกีฬาฟุตบอลแห่งประเทศไทยฯ โดยมวลน้ำได้หลากเข้าท่วมบริเวณชั้น 1 ซึ่งเป็นพื้นที่สำนักงานของฝ่ายต่างๆ ส่งผลให้ระบบไฟฟ้า และระบบสัญญาณการสื่อสารทั้งหมดไม่สามารถใช้งานได้ อุปกรณ์สำนักงานต่างๆ ได้รับความเสียหาย รวมถึงรถตู้ของสมาคมจำนวน 4 คัน เนื่องจากระดับน้ำเพิ่มสูงขึ้นอย่างรวดเร็วในช่วงกลางดึกของวันที่ 26 ก.ย.
ล่าสุด หลังจากระดับน้ำเริ่มลดลง บุคลากรของสมาคมพร้อมด้วยทีมช่างผู้เชี่ยวชาญได้เข้าตรวจสอบความเสียหายและฟื้นฟูระบบต่างๆ อย่างเร่งด่วน เพื่อให้ กลับมาใช้งานได้ตามปกติ ทั้งนี้คาดว่ากระบวนการปรับปรุงและฟื้นฟูความเสียหายทั้งหมดจะใช้ระยะเวลาประมาณ 2-3 สัปดาห์
